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SPECIFICITE REGIONALE DE L'INTEGRATION VIRALE DANS LES GENOMES DES MAMMIFERES

Information

Langue d'expression : français
Date de parution :  1996

Notes

Note publique d'information : 
LES CONCLUSIONS PRINCIPALES DE CETTE THESE CONCERNENT TROIS SUJETS: LA DISTRIBUTION DES GENES DANS LE GENOME HUMAIN, L'EXISTENCE DE DEUX CLASSES COMPOSITIONNELLES DES GENOMES RETROVIRAUX ET L'INTEGRATION COMPARTIMENTEE ET ISOPYCNIQUE DES SEQUENCES VIRALES. LE GENOME HUMAIN (COMME CELUI DES AUTRES MAMMIFERES) EST CONSTITUE PAR UNE MOSAIQUE DE LONGS SEGMENTS D'ADN, LES ISOCHORES, QUI SONT CARACTERISES PAR UNE COMPOSITION EN BASES NUCLEOTIDIQUES TRES HOMOGENE ET QUI APPARTIENNENT A UN PETIT NOMBRE DE FAMILLES L, H1, H2 ET H3 (REPRESENTANT 63, 24, 8 ET 5% DU GENOME HUMAIN RESPECTIVEMENT). LA CONCENTRATION EN GENES EST FAIBLE DANS LA FAMILLE L PAUVRE EN GC, ELLE AUGMENTE AVEC L'ACCROISSEMENT DE GC DANS LES FAMILLES H1 ET H2, ET ATTEINT UN MAXIMUM DANS LA FAMILLE H3, LA PLUS RICHE EN GC. DANS CETTE FAMILLE, QUI REPRESENTE MOINS DE 5% DU GENOME, LA CONCENTRATION EN GENES EST 17 FOIS PLUS ELEVEE QUE DANS LA FAMILLE L PAUVRE EN GC QUI REPRESENTE PLUS DE 63% DU GENOME. L'ETUDE DE LA DISTRIBUTION COMPOSITIONNELLE DES GENOMES RETROVIRAUX A MONTRE UNE BIMODALITE FRAPPANTE QUI EST ACCOMPAGNEE PAR UNE REMARQUABLE HOMOGENEITE DE COMPOSITION AU SEIN DE CHAQUE GENOME RETROVIRAL. LES RETROVIRUS SONT DIVISES EN DEUX CLASSES COMPOSITIONNELLES: LA CLASSE RICHE EN GC QUI COMPREND TOUS LES ONCOVIRUS, ET LA CLASSE PAUVRE EN GC QUI EST REPRESENTE EN MAJORITE PAR DES LENTI- ET DES SPUMAVIRUS. LA BIMODALITE DE LA DISTRIBUTION COMPOSITIONNELLE DES GENOMES RETROVIRAUX ET LEUR HOMOGENEITE COMPOSITIONNELLE PEUVENT RESULTER DE L'EVOLUTION COMPOSITIONNELLE DES RETROVIRUS DANS LEUR FORME INTEGREE. L'INTEGRATION DES VIRUS DANS LE GENOME HOTE EST COMPARTIMENTEE ET ISOPYCNIQUE: LES PROVIRUS TRANSCRITS ET RICHES EN GC SONT LOCALISEES DANS LES COMPARTIMENTS DU GENOME CELLULAIRE RICHES EN GC (ET EN GENES) QUI REPRESENTENT (CHEZ L'HOMME) <12% DE L'ADN GENOMIQUE ET QUI SONT PROCHES EN COMPOSITION A DES SEQUENCES PROVIRALES. PAR CONTRE, LES PROVIRUS PAUVRES EN GC SONT LOCALISES DANS LES COMPARTIMENTS GENOMIQUES PAUVRES EN GC. LA LOCALISATION COMPARTIMENTEE ET ISOPYCNIQUE DES GENOMES VIRAUX EST SEMBLABLE A CELLE DES ELEMENTS MOBILES, QUI S'INTEGRENT PAR RETROPOSITION. LA SITUATION, OBSERVEE POUR LES SEQUENCES VIRALES INTEGREES ET LES SEQUENCES MOBILES, EST TRES PROCHE DE CE QUI A ETE TROUVE POUR LES SEQUENCES CODANTES EN GENERAL: ELLES SONT CORRELEES COMPOSITIONNELLEMENT AVEC LES REGIONS DU GENOME OU ELLES SONT LOCALISEES


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