Note publique d'information : Les biofilms sont des populations microbiennes associées aux surfaces et englobées
dans une matrice extracellulaire. Ce mode de vie fixé est présent dans tous les environnements
et notamment dans les domaines médicaux et industriels où il est fréquemment nuisible.
La présence des biofilms est en effet problématique en raison de leurs capacités importantes
de dissémination et de résistance aux agents anti-bactériens. Au cours de la formation
du biofilm, les bactéries synthétisent différentes structures d'adhésion de surface
soumises à un réseau complexe de régulations. En effet, la formation des biofilms
est associée à une modification du profil d'expression des gènes et à la mise en place
de réponses physiologiques spécifiques. L'objectif de mon travail de thèse est l'exploration
de la diversité des facteurs d'adhésion impliqués dans la formation des biofilms chez
E. coli et Salmonella. J'ai développé une technique génétique permettant la modulation
fine de l'expression de gènes cibles. Cet outil a été utilisé pour mettre en évidence
de nouvelles adhésines chez E. coli et S. enteritica. J'ai également identifié deux
gènes, ychA et ycbB, présents sur le plasmide conjugatif F qui codent pour des adhésines
autotransporteurs et j'ai étudié leur rôle dans l'adhésion et la formation de biofilms
chez E. coli. Enfin, j'ai étudié le rôle des gènes rhs dans la formation des biofilms.
Ces gènes n'ont pas de fonction connue et sont considérés comme cryptiques dans les
conditions de laboratoire. J'ai montré qu'ils étaient exprimés en biofilm ce qui suggère
qu'ils jouent un rôle dans sa formation. Mon travail met en évidence la diversité
des structures d'adhésion impliquées dans la formation des biofilms.
Note publique d'information : Biofilms are heterogeneous microbial populations associated to surfaces and encased
in an extracellular matrix. They are very common in all type of ecological niches
and they are often found in medical and industrial environments where they are frequently
harmful. The presence of biofilms is indeed problematic because of their high scattering
capacities and resistances to anti-bacterial agents. During biofilm formation, bacteria
synthesize various adhesive surface structures subjected to a complex network of regulations.
Indeed, biofilm formation leads to a modification of the gene expression profile and
to specific physiological answers. The objectives of my phD work is the exploration
of factors involved in biofilm formation in E. coli and Salmonella. I first developed
a new genetical tool which allows thé modulation of target genes expression, to identify
news adhesins in E. coli and S. enteritica. I also identified two genes, ychA and
ycbB, located on the F conjugative plasmid, which encode autotransporters adhesins
and I studied their role in E. coli biofilm formation. Finally, I investigated the
role of the rhs genes in biofilm formation. These genes of unknown function are considered
as cryptic in laboratory conditions. I showed that they are specifically expressed
in biofilm suggesting that they play a role in its formation. All these results show
the wide variety of adhesion factors that are involved in biofilm formation.
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