Identifiant pérenne de la notice : 247840890
Notice de type
Notice de regroupement
Note publique d'information : OSIRIS EST UNE METHODE DE PREDICTION AB INITIO DE LA STRUCTURE TRIDIMENSIONNELLE DES
PETITES PROTEINES GLOBULAIRES. ELLE A ETE INITIALEMENT PUBLIEE EN 1995, LES RMSD OBTENUS
POUR TROIS PETITES PROTEINES EN HELICE ALPHA, LES POLYPEPTIDES PANCREATIQUES AVIAIRE
ET BOVIN ET LA PROTEINE DE LIAISON AU CALCIUM ETAIENT RESPECTIVEMENT DE 3,8A, 3,7A
ET 5,3A. LES CALCULS EFFECTUES SUR DES PROTEINES DE TYPE BETA OU MIXTE (ALPHA/BETA)
NE PERMETTAIENT PAS DE REPRODUIRE LES STRUCTURES TRIDIMENSIONNELLES (3-D) NATIVES.
NOUS AVONS DONC ENTREPRIS L'OPTIMISATION DE LA METHODE. OSIRIS EST SCHEMATIQUEMENT
COMPOSEE DE DEUX GRANDES ETAPES D'EXPLORATION DE LA CARTE DE RAMACHANDRAN POUR ASSIGNER
LES STRUCTURES SECONDAIRES ET UNE ETAPE DE DYNAMIQUE ANGULAIRE POUR TENTER DE COMPACTER
LA STRUCTURE OBTENUE A LA FIN DE L'ETAPE I. LE TRAVAIL A CONSISTE A MODIFIER LA METHODOLOGIE
DE L'ETAPE I ET A TESTER LES FACTEURS DE PONDERATION DES TERMES ENERGETIQUES DU CHAMP
DE FORCES, POUR TENTER DE SIMULER AU MIEUX LES REPLIEMENT NATIFS DE QUATRE PROTEINES,
LES POLYPEPTIDES PANCREATIQUES AVIAIRE ET BOVIN LA PROTEINE DE LIAISON AU CALCIUM
ET LE DOMAINE SH3 DE LA TYROSINE KINASE ABL. L'OPTIMISATION, ENCORE PARTIELLE DE LA
PREMIERE ETAPE D'OSIRIS, AMENE NEANMOINS A DES RESULTATS INTERESSANTS ET NOUS PERMET
DE MIEUX COMPRENDRE L'INFLUENCE DE CERTAINES PROCEDURES DE CALCULS OU DE CERTAINS
FACTEURS DE PONDERATION SUR LA QUALITE DES STRUCTURES CALCULEES.
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